聯系我們

内參蛋白,你選對了嗎?

2020/3/18 14:41:27      點擊:

内參蛋白是用(yòng)來确保蛋白上樣量一緻性,量化目的蛋白的表達情況,是免疫印迹(WB)和免疫熒光(IF)等實驗結果定量分(fēn)析或定性比較的重要标尺。

 

内參蛋白,你選對了嗎?

 

内參蛋白主要是一些持家基因,這些持家基因執行大量的基本功能(néng),并持續在多(duō)種組織和細胞中(zhōng)高水平表達。 常見内參蛋白包括Actin、Tubulin、GAPDH、Histone H3等。但是,研究不同類型的蛋白,對内參的選擇是有(yǒu)講究的,如1)胞漿蛋白的内參與胞核蛋白的内參是不一樣的;2)在一定的實驗條件下,内參蛋白的表達發生明顯的變化時需要選擇其他(tā)表達不變或者變化很(hěn)小(xiǎo)的蛋白;3)當研究的蛋白的分(fēn)子量與内參接近時,需要選擇分(fēn)子量與目的蛋白的分(fēn)子量差距比較大的蛋白等。

 

以下這張圖歸納了不同細胞組分(fēn)對應的内參及其分(fēn)子量,掌握了這張圖,内參選擇不再難。快動動你的手指收藏起來吧!

該圖來自CST Guide 科(kē)研寶典:《CST Guide: Pathways & Protocols》。

 

多(duō)數情況下,内參蛋白的表達量很(hěn)高且穩定,但是,特定的實驗條件(環境壓力,外界因素刺激等)會引起這些内參蛋白的變化,因此有(yǒu)些内參在不同實驗條件或研究模型下不适合選擇,我們總結了最近研究的結果,列出有(yǒu)些實驗條件下不适的内參供參考:

 

研究結腸癌的發生及轉移時,細胞骨架蛋白Vinculin不适合做全細胞的内參。近期研究表明,結腸癌中(zhōng)Vinculin表達的減少和增加與緻癌和轉移有(yǒu)關聯(1)。

 

在環境壓力下,HSP70和HSP90被誘導而表達發生變化,盡管HSP70和HSP90正常情況下是組成性表達的分(fēn)子伴侶,能(néng)夠保持蛋白合成穩态,但環境壓力下,HSP70和HSP90不适合胞漿蛋白的内參(2)。

 

當細胞發生凋亡的時候,核多(duō)聚(ADP-核糖) 聚合酶PARP和核膜的結構組分(fēn)Lamins,都不适合做核蛋白的内參。在凋亡細胞體(tǐ)内,PARP是caspase-3裂解的主要靶蛋白之一(3)。Lamin A/C能(néng)夠被caspase-6切割,可(kě)以作(zuò)為(wèi)caspase-6激活的标志(zhì)。在凋亡過程中(zhōng),Lamin A/C能(néng)夠被特異地剪切成大片段(41-50 kDa)和小(xiǎo)片段 (28 kDa)。Lamin的剪切會引起細胞核的失調和細胞死亡(4,5)。

 

VDAC(電(diàn)壓依賴性陰離子通道) 廣泛表達,定位于線(xiàn)粒體(tǐ)外膜,通常認為(wèi)這是代謝(xiè)傳入或傳出線(xiàn)粒體(tǐ)的主要方式。另外,這個通道在凋亡信号中(zhōng)發揮重要作(zuò)用(yòng)。Bcl-2家族蛋白調控凋亡過程中(zhōng)線(xiàn)粒體(tǐ)通透性的改變,他(tā)們能(néng)結合VDAC改變通道的動力(6)。VDAC的同二聚體(tǐ)化可(kě)能(néng)是一種改變線(xiàn)粒體(tǐ)通透性和促進細胞色素C 釋放的機制。

 

Cofilin 屬于一組保守的小(xiǎo)Actin-結合蛋白家族,在胞質(zhì)分(fēn)裂,内吞,胚胎發育,壓力應激和組織再生過程中(zhōng)發揮了關鍵作(zuò)用(yòng)。在刺激因素作(zuò)用(yòng)下,Cofilin作(zuò)為(wèi)提前存在的細絲促進Actin肌動蛋白絲的再生(7)。Cofilin的第3位絲氨酸被LIMK或TESK磷酸化後會抑制Cofilin的這種作(zuò)用(yòng)(8)。

 

Actin,一種廣泛表達的真核蛋白,是細胞骨架的重要組分(fēn)。研究證明在原始乳腺癌細胞中(zhōng)Actin是高度磷酸化的(9)。研究也發現凋亡條件下體(tǐ)外和心髒肌肉以及骨骼肌中(zhōng)都能(néng)觀察到Actin的清除(10),因此,不适用(yòng)于骨骼肌的樣品。Caspase-3對Actin的清除會加速泛素/蛋白酶體(tǐ)依賴的肌肉蛋白酶解(11)。 細胞生長(cháng)條件的改變以及與胞外基質(zhì)組分(fēn)的相互作(zuò)用(yòng)都可(kě)能(néng)會導緻Actin蛋白合成的變化 。

 

GAPDH(甘油醛-3-磷酸脫氫酶), 在糖酵解過程中(zhōng)将3-磷酸甘油醛進一步磷酸化。雖然在不同組織中(zhōng)的表達水平有(yǒu)差異,但GAPDH普遍被認為(wèi)是一個組成型表達的持家蛋白。正是由于這個原因,GAPDH的mRNA和蛋白通常在對其它有(yǒu)變化的靶蛋白測定實驗時作(zuò)為(wèi)對照。當代謝(xiè)信号通路受到影響時GAPDH 不适合做内參等。

 

球形微管蛋白亞基包含微管建築塊,由α/β-tubulin異源二聚體(tǐ)形成所有(yǒu)真核細胞的tubulin亞單位。 對抗微生物(wù)和抗有(yǒu)絲分(fēn)裂藥物(wù)耐受性的不同而會導緻Tubulin的表達發生變化 。

 

為(wèi)了滿足你各種實驗的需要,CST 為(wèi)您準備了含優選貨号的内參Sampler kit,性價比高,購(gòu)買方便。

 

#4670 Loading Control Antibody Sampler Kit (HRP Conjugate) 

 

#5142 Loading Control Antibody Sampler Kit 

 

#9774 Loading Control Antibody Sampler Kit (Mouse) 

 

内參相關産(chǎn)品,請看下表:

 

Loadong Control

 No.

Applications

Reactivity

Vinculin

13901

W IHC-P F

H M R Mk

18799

W

H M R Mk

4650

W

H M R Mk Dg

HSP90

4877

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk (B)

70657

F

H M R Mk (B)

79641

W

H M R Mk (B)

4874

W IHC-P

H M R Mk Dm Z (C) (B)

4875

W IHC-P F

H M R Mk (B)

HSP70

46477

W IHC-P

H

4873

W IP IHC-P IF-IC F

H Mk

4872

W IHC-P

H M R Mk B

4876

W

H M R Mk

HSP60

12165

W IHC-P IF-IC F

H M R Hm Mk X Z B Pg (C) (Dg)  (Hr)

46611

W

H M R Hm Mk X Z B Pg (C) (Dg)  (Hr)

56831

F

H M R Hm Mk X Z B Pg (C) (Dg)  (Hr)

4869

W IF-IC F

H M R Mk Dm

4870

W IF-IC F

H M R Mk Dm

MEK1/2

13033

W

H M R Mk Dm (Hm) (X) (Z) (B)  (Dg) (Pg) (Ce)

28708

F

H M R Mk Dm (Hm) (X) (Z) (B)  (Dg) (Pg) (Ce)

4694

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk

8727

W IF-IC F

H M R Mk Dm (Hm) (X) (Z) (B)  (Dg) (Pg) (Ce)

9122

W IP

H M R Mk Dm (C) (X)

9126

W

H M R Mk (Dg)

GAPDH

2118

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk B Pg (Pg)

3683

W

H M R Mk B Pg (Pg)

3906

IF-IC F CS-CA

H M R Mk B Pg (Pg)

3907

IF-IC F

H M R Mk B Pg (Pg)

5014

W

H M R Mk B Pg (Pg)

5174

W IHC-P IF-IC

H M R Mk (Pg)

8884

W

H M R Mk (Pg)

97166

W

H M R Mk

PARP

6704

IP

H M R Mk

9532

W IP IF-IC

H M R Mk

9542

W

H M R Mk

Lamin  A/C

4777

W IP IHC-P IF-F IF-IC F

H M R Mk

53496

F

H M R Mk

8617

IF-F IF-IC F

H M R Mk

2032

W IHC-P

H M R (B)

Lamin  B1 

12586

W

H M R (Mk) (Pg)

13435

W IP

H M R (B) (Dg) (Pg)

15068

W

H M R (B) (Dg) (Pg)

HDAC1

34589

W IP IF-IC ChIP

H M R Mk

5356

W IP

H M R Mk

59581

W

H M R Mk

2062

W

H M R Mk

TBP

12578

W IP ChIP

H Mk

44059

W IP ChIP

H M R Mk (C) (B)

8515

W

H M R Mk

PCNA

13110

W IP IHC-P IF-F IF-IC F

H M R Mk

2586

W IP IHC-P IF-IC F

H M R Mk B Pg

8580

IF-IC F

H M R Mk B Pg

HistoneH3

12167

F

H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z)  (B)

12230

IF-IC F

H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z)  (B)

5748

W

H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z)  (B)

4620

ChIP

H M (R) (Hm) (Mk) (C) (Dm) (X)  (Z) (B)

5192

W

H M R Hm Mk Dm Z B Dg Pg

12648

W

H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z)  (B)

14269

W IHC-P IF-IC F ChIP

H M R Mk

3638

W

H M R Mk (Dm) (X) (Hr)

3680

IHC-P

H (M) (R) (Mk) (Dm) (X) (Hr)

4499

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z)  (B)

82241

F CS-CA

H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z)  (B)

9717

W

H M R Hm Mk Dm Z B Dg Pg

2650

ChIP

H M (R) (Mk) (C) (Dm) (X) (Z)  (B) (Hr)

9715

W

H M R Mk Z B Pg (Dm)

VDAC 

12454

W

H M R Mk

4661

W

H M R Mk

4866

W IHC-P

H M R B

COX IV

11967

W IP IHC-P IF-IC

H M R Mk

4850

W IP IHC-P IHC-F IF-IC F

H R Mk Z B Pg

4853

IF-IC F

H R Mk Z B Pg

5247

W

H R Mk Z B Pg

7561

IF-IC F

H R Mk Z B Pg

8692

IF-IC

H R Mk Z B Pg

8693

IF-IC

H R Mk Z B Pg

4844

W IP IHC-P F

H M R Mk B

α-Actinin 

12413

W

H M R Mk (Z)

6487

W IF-IC

H M R Mk (Z)

3134

W IF-IC

H M R Hm Mk

β-Actin

12262

W

H M R Hm Mk Dg

12620

W

H M R Mk (Hm) (C) (B) (Pg)

3700

W IHC-P IF-IC F

H M R Hm Mk Dg

4970

W IHC-P IHC-F IF-IC F

H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr)

5057

W F

H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr)

5125

W

H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr)

8046

IF-IC

H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr)

8457

W IF-IC F

H M R Mk (Hm) (C) (B) (Pg)

8584

IF-IC F

H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr)

8844

IF-IC F

H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr)

9470

IF-IC

H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr)

4967

W

H M R Hm Mk Mi Dm Z B (C) (X)  (Dg) (Pg) (Hr)

α-Tubulin

12351

W

H M R Mk

2125

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk Dm Z B Pg (Dg)

3873

W IHC-P IF-IC

H M R Mk

4285

W

H M R Mk Dm Z B Pg (Dg)

5046

IF-IC F

H M R Mk Dm Z B Pg (Dg)

5059

IF-IC

H M R Mk Dm Z B Pg (Dg)

5063

IF-IC F CS-CA

H M R Mk Dm Z B Pg (Dg)

8058

IF-IC F

H M R Mk

9099

W

H M R Mk Dm Z B Pg (Dg)

2144

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk Dm B (X)

β-Tubulin

15115

W IHC-P IF-IC

H M R Mk

2128

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk Z B (C)

3623

IF-IC F

H M R Mk Z B (C)

3624

IF-IC F

H M R Mk Z B (C)

5346

W

H M R Mk Z B (C)

56739

W

H M R Mk

2116

IF-IC

H M R Mk Z B (C)

6181

W

H M R Mk Z B (C)

7634

IF-IC

H M R Mk Z B (C)

86298

W IHC-P IF-IC

H M R Hm Mk

2146

W IHC-P IF-IC F

H M R Mk Z B (X)

Cofilin

5175

W IF-IC

H M R Mk Dg

8503

W

H M R Mk Dg

3318

W

H M R Mk B

Profilin-1

3246

W

H M R Hm Mk Dg

3237

W IF-IC F

H M R B

Cadherin

4073

W

H M R

4068

W IP IHC-P

H M R Mk Dm Z B

Na,K-ATPase

3010

W

H M R Hm Mk Z

CD71 

13113

W IP IF-IC F

H

13208

W IP IF-IC

H

82582

F

H

Caveolin-1

3267

W IP IHC-P IF-IC F

H M R Hm Mk B Dg

3238

W IP IHC-P IHC-F IF-IC F

H M R Hm Z B Pg

12506

W

H M R Hm Mk B Dg

Sampler  Kit

為(wèi)了滿足你各種實驗的需要CST 為(wèi)您準備了含優選貨号的内參Sampler kit性價比高購(gòu)買方便。

9774

Loading Control  Antibody Sampler Kit (Mouse)

4670

Loading Control  Antibody Sampler Kit (HRP Conjugate)

5142

Loading Control  Antibody Sampler Kit

 

參考文(wén)獻:

1.         Yang, H.J. et al. (2010) Cancer Invest 28, 127-34.

2.         Nollen, E.A. and Morimoto, R.I. (2002) J. Cell Sci. 115, 2809-2816.

3.         Tewari, M. et al. (1995) Cell 81, 801-809.

4.         Oberhammer, F.A. et al. (1994) J Cell Biol 126, 827-37.

5.         Rao, L. et al. (1996) J Cell Biol 135, 1441-55.

6.         Shimizu, S. et al. (1999) Nature 399, 483-7.

7.         Condeelis, J. (2001) Trends Cell Biol 11, 288-93.

8.         Toshima, J. et al. (2001) J Biol Chem 276, 31449-58.

9.         Lim, Y.P. et al. (2004) Clin. Cancer Res. 10, 3980-3987.

10.      Communal, C. et al. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99, 6252-6256.

11.      Du, J. et al. (2004) J. Clin. Invest. 113, 115-123.