内參蛋白,你選對了嗎?
内參蛋白是用(yòng)來确保蛋白上樣量一緻性,量化目的蛋白的表達情況,是免疫印迹(WB)和免疫熒光(IF)等實驗結果定量分(fēn)析或定性比較的重要标尺。
内參蛋白,你選對了嗎?
内參蛋白主要是一些持家基因,這些持家基因執行大量的基本功能(néng),并持續在多(duō)種組織和細胞中(zhōng)高水平表達。 常見内參蛋白包括Actin、Tubulin、GAPDH、Histone H3等。但是,研究不同類型的蛋白,對内參的選擇是有(yǒu)講究的,如1)胞漿蛋白的内參與胞核蛋白的内參是不一樣的;2)在一定的實驗條件下,内參蛋白的表達發生明顯的變化時需要選擇其他(tā)表達不變或者變化很(hěn)小(xiǎo)的蛋白;3)當研究的蛋白的分(fēn)子量與内參接近時,需要選擇分(fēn)子量與目的蛋白的分(fēn)子量差距比較大的蛋白等。
以下這張圖歸納了不同細胞組分(fēn)對應的内參及其分(fēn)子量,掌握了這張圖,内參選擇不再難。快動動你的手指收藏起來吧!
該圖來自CST Guide 科(kē)研寶典:《CST Guide: Pathways & Protocols》。
多(duō)數情況下,内參蛋白的表達量很(hěn)高且穩定,但是,特定的實驗條件(環境壓力,外界因素刺激等)會引起這些内參蛋白的變化,因此有(yǒu)些内參在不同實驗條件或研究模型下不适合選擇,我們總結了最近研究的結果,列出有(yǒu)些實驗條件下不适的内參供參考:
研究結腸癌的發生及轉移時,細胞骨架蛋白Vinculin不适合做全細胞的内參。近期研究表明,結腸癌中(zhōng)Vinculin表達的減少和增加與緻癌和轉移有(yǒu)關聯(1)。
在環境壓力下,HSP70和HSP90被誘導而表達發生變化,盡管HSP70和HSP90正常情況下是組成性表達的分(fēn)子伴侶,能(néng)夠保持蛋白合成穩态,但環境壓力下,HSP70和HSP90不适合胞漿蛋白的内參(2)。
當細胞發生凋亡的時候,核多(duō)聚(ADP-核糖) 聚合酶PARP和核膜的結構組分(fēn)Lamins,都不适合做核蛋白的内參。在凋亡細胞體(tǐ)内,PARP是caspase-3裂解的主要靶蛋白之一(3)。Lamin A/C能(néng)夠被caspase-6切割,可(kě)以作(zuò)為(wèi)caspase-6激活的标志(zhì)。在凋亡過程中(zhōng),Lamin A/C能(néng)夠被特異地剪切成大片段(41-50 kDa)和小(xiǎo)片段 (28 kDa)。Lamin的剪切會引起細胞核的失調和細胞死亡(4,5)。
VDAC(電(diàn)壓依賴性陰離子通道) 廣泛表達,定位于線(xiàn)粒體(tǐ)外膜,通常認為(wèi)這是代謝(xiè)傳入或傳出線(xiàn)粒體(tǐ)的主要方式。另外,這個通道在凋亡信号中(zhōng)發揮重要作(zuò)用(yòng)。Bcl-2家族蛋白調控凋亡過程中(zhōng)線(xiàn)粒體(tǐ)通透性的改變,他(tā)們能(néng)結合VDAC改變通道的動力(6)。VDAC的同二聚體(tǐ)化可(kě)能(néng)是一種改變線(xiàn)粒體(tǐ)通透性和促進細胞色素C 釋放的機制。
Cofilin 屬于一組保守的小(xiǎo)Actin-結合蛋白家族,在胞質(zhì)分(fēn)裂,内吞,胚胎發育,壓力應激和組織再生過程中(zhōng)發揮了關鍵作(zuò)用(yòng)。在刺激因素作(zuò)用(yòng)下,Cofilin作(zuò)為(wèi)提前存在的細絲促進Actin肌動蛋白絲的再生(7)。Cofilin的第3位絲氨酸被LIMK或TESK磷酸化後會抑制Cofilin的這種作(zuò)用(yòng)(8)。
Actin,一種廣泛表達的真核蛋白,是細胞骨架的重要組分(fēn)。研究證明在原始乳腺癌細胞中(zhōng)Actin是高度磷酸化的(9)。研究也發現凋亡條件下體(tǐ)外和心髒肌肉以及骨骼肌中(zhōng)都能(néng)觀察到Actin的清除(10),因此,不适用(yòng)于骨骼肌的樣品。Caspase-3對Actin的清除會加速泛素/蛋白酶體(tǐ)依賴的肌肉蛋白酶解(11)。 細胞生長(cháng)條件的改變以及與胞外基質(zhì)組分(fēn)的相互作(zuò)用(yòng)都可(kě)能(néng)會導緻Actin蛋白合成的變化 。
GAPDH(甘油醛-3-磷酸脫氫酶), 在糖酵解過程中(zhōng)将3-磷酸甘油醛進一步磷酸化。雖然在不同組織中(zhōng)的表達水平有(yǒu)差異,但GAPDH普遍被認為(wèi)是一個組成型表達的持家蛋白。正是由于這個原因,GAPDH的mRNA和蛋白通常在對其它有(yǒu)變化的靶蛋白測定實驗時作(zuò)為(wèi)對照。當代謝(xiè)信号通路受到影響時GAPDH 不适合做内參等。
球形微管蛋白亞基包含微管建築塊,由α/β-tubulin異源二聚體(tǐ)形成所有(yǒu)真核細胞的tubulin亞單位。 對抗微生物(wù)和抗有(yǒu)絲分(fēn)裂藥物(wù)耐受性的不同而會導緻Tubulin的表達發生變化 。
為(wèi)了滿足你各種實驗的需要,CST 為(wèi)您準備了含優選貨号的内參Sampler kit,性價比高,購(gòu)買方便。
#4670 Loading Control Antibody Sampler Kit (HRP Conjugate)
#5142 Loading Control Antibody Sampler Kit
#9774 Loading Control Antibody Sampler Kit (Mouse)
内參相關産(chǎn)品,請看下表:
Loadong Control |
No. |
Applications |
Reactivity |
Vinculin |
13901 |
W IHC-P F |
H M R Mk |
18799 |
W |
H M R Mk |
|
4650 |
W |
H M R Mk Dg |
|
HSP90 |
4877 |
W IHC-P IF-IC F |
H M R Mk (B) |
70657 |
F |
H M R Mk (B) |
|
79641 |
W |
H M R Mk (B) |
|
4874 |
W IHC-P |
H M R Mk Dm Z (C) (B) |
|
4875 |
W IHC-P F |
H M R Mk (B) |
|
HSP70 |
46477 |
W IHC-P |
H |
4873 |
W IP IHC-P IF-IC F |
H Mk |
|
4872 |
W IHC-P |
H M R Mk B |
|
4876 |
W |
H M R Mk |
|
HSP60 |
12165 |
W IHC-P IF-IC F |
H M R Hm Mk X Z B Pg (C) (Dg) (Hr) |
46611 |
W |
H M R Hm Mk X Z B Pg (C) (Dg) (Hr) |
|
56831 |
F |
H M R Hm Mk X Z B Pg (C) (Dg) (Hr) |
|
4869 |
W IF-IC F |
H M R Mk Dm |
|
4870 |
W IF-IC F |
H M R Mk Dm |
|
MEK1/2 |
13033 |
W |
H M R Mk Dm (Hm) (X) (Z) (B) (Dg) (Pg) (Ce) |
28708 |
F |
H M R Mk Dm (Hm) (X) (Z) (B) (Dg) (Pg) (Ce) |
|
4694 |
W IHC-P IF-IC F |
H M R Mk |
|
8727 |
W IF-IC F |
H M R Mk Dm (Hm) (X) (Z) (B) (Dg) (Pg) (Ce) |
|
9122 |
W IP |
H M R Mk Dm (C) (X) |
|
9126 |
W |
H M R Mk (Dg) |
|
GAPDH |
2118 |
W IHC-P IF-IC F |
H M R Mk B Pg (Pg) |
3683 |
W |
H M R Mk B Pg (Pg) |
|
3906 |
IF-IC F CS-CA |
H M R Mk B Pg (Pg) |
|
3907 |
IF-IC F |
H M R Mk B Pg (Pg) |
|
5014 |
W |
H M R Mk B Pg (Pg) |
|
5174 |
W IHC-P IF-IC |
H M R Mk (Pg) |
|
8884 |
W |
H M R Mk (Pg) |
|
97166 |
W |
H M R Mk |
|
PARP |
6704 |
IP |
H M R Mk |
9532 |
W IP IF-IC |
H M R Mk |
|
9542 |
W |
H M R Mk |
|
Lamin A/C |
4777 |
W IP IHC-P IF-F IF-IC F |
H M R Mk |
53496 |
F |
H M R Mk |
|
8617 |
IF-F IF-IC F |
H M R Mk |
|
2032 |
W IHC-P |
H M R (B) |
|
Lamin B1 |
12586 |
W |
H M R (Mk) (Pg) |
13435 |
W IP |
H M R (B) (Dg) (Pg) |
|
15068 |
W |
H M R (B) (Dg) (Pg) |
|
HDAC1 |
34589 |
W IP IF-IC ChIP |
H M R Mk |
5356 |
W IP |
H M R Mk |
|
59581 |
W |
H M R Mk |
|
2062 |
W |
H M R Mk |
|
TBP |
12578 |
W IP ChIP |
H Mk |
44059 |
W IP ChIP |
H M R Mk (C) (B) |
|
8515 |
W |
H M R Mk |
|
PCNA |
13110 |
W IP IHC-P IF-F IF-IC F |
H M R Mk |
2586 |
W IP IHC-P IF-IC F |
H M R Mk B Pg |
|
8580 |
IF-IC F |
H M R Mk B Pg |
|
HistoneH3 |
12167 |
F |
H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z) (B) |
12230 |
IF-IC F |
H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z) (B) |
|
5748 |
W |
H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z) (B) |
|
4620 |
ChIP |
H M (R) (Hm) (Mk) (C) (Dm) (X) (Z) (B) |
|
5192 |
W |
H M R Hm Mk Dm Z B Dg Pg |
|
12648 |
W |
H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z) (B) |
|
14269 |
W IHC-P IF-IC F ChIP |
H M R Mk |
|
3638 |
W |
H M R Mk (Dm) (X) (Hr) |
|
3680 |
IHC-P |
H (M) (R) (Mk) (Dm) (X) (Hr) |
|
4499 |
W IHC-P IF-IC F |
H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z) (B) |
|
82241 |
F CS-CA |
H M R Mk (Hm) (C) (Dm) (X) (Z) (B) |
|
9717 |
W |
H M R Hm Mk Dm Z B Dg Pg |
|
2650 |
ChIP |
H M (R) (Mk) (C) (Dm) (X) (Z) (B) (Hr) |
|
9715 |
W |
H M R Mk Z B Pg (Dm) |
|
VDAC |
12454 |
W |
H M R Mk |
4661 |
W |
H M R Mk |
|
4866 |
W IHC-P |
H M R B |
|
COX IV |
11967 |
W IP IHC-P IF-IC |
H M R Mk |
4850 |
W IP IHC-P IHC-F IF-IC F |
H R Mk Z B Pg |
|
4853 |
IF-IC F |
H R Mk Z B Pg |
|
5247 |
W |
H R Mk Z B Pg |
|
7561 |
IF-IC F |
H R Mk Z B Pg |
|
8692 |
IF-IC |
H R Mk Z B Pg |
|
8693 |
IF-IC |
H R Mk Z B Pg |
|
4844 |
W IP IHC-P F |
H M R Mk B |
|
α-Actinin |
12413 |
W |
H M R Mk (Z) |
6487 |
W IF-IC |
H M R Mk (Z) |
|
3134 |
W IF-IC |
H M R Hm Mk |
|
β-Actin |
12262 |
W |
H M R Hm Mk Dg |
12620 |
W |
H M R Mk (Hm) (C) (B) (Pg) |
|
3700 |
W IHC-P IF-IC F |
H M R Hm Mk Dg |
|
4970 |
W IHC-P IHC-F IF-IC F |
H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr) |
|
5057 |
W F |
H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr) |
|
5125 |
W |
H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr) |
|
8046 |
IF-IC |
H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr) |
|
8457 |
W IF-IC F |
H M R Mk (Hm) (C) (B) (Pg) |
|
8584 |
IF-IC F |
H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr) |
|
8844 |
IF-IC F |
H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr) |
|
9470 |
IF-IC |
H M R Mk B Pg (Hm) (C) (Dg) (Hr) |
|
4967 |
W |
H M R Hm Mk Mi Dm Z B (C) (X) (Dg) (Pg) (Hr) |
|
α-Tubulin |
12351 |
W |
H M R Mk |
2125 |
W IHC-P IF-IC F |
H M R Mk Dm Z B Pg (Dg) |
|
3873 |
W IHC-P IF-IC |
H M R Mk |
|
4285 |
W |
H M R Mk Dm Z B Pg (Dg) |
|
5046 |
IF-IC F |
H M R Mk Dm Z B Pg (Dg) |
|
5059 |
IF-IC |
H M R Mk Dm Z B Pg (Dg) |
|
5063 |
IF-IC F CS-CA |
H M R Mk Dm Z B Pg (Dg) |
|
8058 |
IF-IC F |
H M R Mk |
|
9099 |
W |
H M R Mk Dm Z B Pg (Dg) |
|
2144 |
W IHC-P IF-IC F |
H M R Mk Dm B (X) |
|
β-Tubulin |
15115 |
W IHC-P IF-IC |
H M R Mk |
2128 |
W IHC-P IF-IC F |
H M R Mk Z B (C) |
|
3623 |
IF-IC F |
H M R Mk Z B (C) |
|
3624 |
IF-IC F |
H M R Mk Z B (C) |
|
5346 |
W |
H M R Mk Z B (C) |
|
56739 |
W |
H M R Mk |
|
2116 |
IF-IC |
H M R Mk Z B (C) |
|
6181 |
W |
H M R Mk Z B (C) |
|
7634 |
IF-IC |
H M R Mk Z B (C) |
|
86298 |
W IHC-P IF-IC |
H M R Hm Mk |
|
2146 |
W IHC-P IF-IC F |
H M R Mk Z B (X) |
|
Cofilin |
5175 |
W IF-IC |
H M R Mk Dg |
8503 |
W |
H M R Mk Dg |
|
3318 |
W |
H M R Mk B |
|
Profilin-1 |
3246 |
W |
H M R Hm Mk Dg |
3237 |
W IF-IC F |
H M R B |
|
Cadherin |
4073 |
W |
H M R |
4068 |
W IP IHC-P |
H M R Mk Dm Z B |
|
Na,K-ATPase |
3010 |
W |
H M R Hm Mk Z |
CD71 |
13113 |
W IP IF-IC F |
H |
13208 |
W IP IF-IC |
H |
|
82582 |
F |
H |
|
Caveolin-1 |
3267 |
W IP IHC-P IF-IC F |
H M R Hm Mk B Dg |
3238 |
W IP IHC-P IHC-F IF-IC F |
H M R Hm Z B Pg |
|
12506 |
W |
H M R Hm Mk B Dg |
|
Sampler Kit 為(wèi)了滿足你各種實驗的需要,CST 為(wèi)您準備了含優選貨号的内參Sampler kit,性價比高,購(gòu)買方便。 |
|||
9774 |
Loading Control Antibody Sampler Kit (Mouse) |
||
4670 |
Loading Control Antibody Sampler Kit (HRP Conjugate) |
||
5142 |
Loading Control Antibody Sampler Kit |
參考文(wén)獻:
1. Yang, H.J. et al. (2010) Cancer Invest 28, 127-34.
2. Nollen, E.A. and Morimoto, R.I. (2002) J. Cell Sci. 115, 2809-2816.
3. Tewari, M. et al. (1995) Cell 81, 801-809.
4. Oberhammer, F.A. et al. (1994) J Cell Biol 126, 827-37.
5. Rao, L. et al. (1996) J Cell Biol 135, 1441-55.
6. Shimizu, S. et al. (1999) Nature 399, 483-7.
7. Condeelis, J. (2001) Trends Cell Biol 11, 288-93.
8. Toshima, J. et al. (2001) J Biol Chem 276, 31449-58.
9. Lim, Y.P. et al. (2004) Clin. Cancer Res. 10, 3980-3987.
10. Communal, C. et al. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99, 6252-6256.
11. Du, J. et al. (2004) J. Clin. Invest. 113, 115-123.
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