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限制性内切酶實驗問題指南

2020/3/23 13:08:13      點擊:

1.限制性内切酶實驗問題指南


 

 

2.高保真限制性内切酶常見問題解答(dá)

Q. 為(wèi)什麽 HF 内切酶推薦使用(yòng)的緩沖液與野生型的内切酶不同?

A. 在許多(duō)情況下,突變導緻高保真内切酶的最适緩沖液發生變化。比如,野生型 SalI 酶的最适緩沖液 NEBuffer 3.1 是高離子強度緩沖液,然而 SalI-HF 的最适緩沖液為(wèi)中(zhōng)等離子強度的 NEBuffer 2.1 CutSmart

Q. 使用(yòng) CutSmart 緩沖液有(yǒu)什麽優勢嗎?

A. 是的,超過 200 種限制性内切酶(包括高保真限制性内切酶)在 CutSmart 緩沖液中(zhōng)有(yǒu)活性。當建立雙酶切
反應時有(yǒu)很(hěn)大優勢。 

 

3.轉化反應問題解決指南                

下面的指南可(kě)用(yòng)于解決轉化過程中(zhōng)所出現的問題。

 

無菌落或液體(tǐ)培養基中(zhōng)無細菌生長(cháng)
• 即使 T7 表達為(wèi)嚴格調控型,但是 T7 表達宿主菌中(zhōng)也可(kě)能(néng)存在低水平的基礎表達。如果表達的蛋白可(kě)能(néng)有(yǒu)毒
  性,表達質(zhì)粒的轉化應使用(yòng)下列系統:
Iq 菌株中(zhōng)過量表達的 LacIq 抑制物(wù)能(néng)夠降低 T7 RNA 聚合酶的基礎表達。
• 在 lysY 菌株中(zhōng),突變的 T7 溶解酶與 T7RNA 聚合酶相結合,從而減少目的蛋白的基礎表達。誘導後,新(xīn)合
  成的 T7 RNA 聚合酶抵消了溶解酶作(zuò)用(yòng),目的蛋白得到表達。
• 30℃ 或室溫培養也可(kě)減輕毒性問題。
• 檢查抗生素濃度(用(yòng)對照質(zhì)粒檢測)。、

 

電(diàn)泳無蛋白或無蛋白活性
• 檢查毒性—細胞可(kě)能(néng)删除或缺失了表達質(zhì)粒的元件。如果有(yǒu)毒性表達問題,試用(yòng)Iq和/或 lysY 宿主以減少基礎
  表達。
• 培養用(yòng)于誘導蛋白表達的細胞。誘導前,将樣品平行塗布于有(yǒu)抗生素和無抗生素選擇标記的平闆。如果有(yǒu)毒性
  産(chǎn)生,則兩個平闆菌落數會有(yǒu)顯著的不同。在含抗生素的平闆上,菌落生長(cháng)數量極少(表明質(zhì)粒丢失了)。

 

誘導蛋白不可(kě)溶

T7 表達蛋白經常産(chǎn)量非常高,導緻目的蛋白不可(kě)溶,解決方案如下:
• 低溫誘導(低溫 12-15℃ 過夜)
• 降低 IPTG 濃度至 0.01 mM-0.1 mM
• 縮短誘導時間(可(kě)以縮短至 15 分(fēn)鍾)
• 細胞生長(cháng)早期開始誘導(OD600 = 0.3 或 0.4)